Hallo,
leider habe ich die Frage nicht ganz verstanden.
Hast Du
a)
3 Spuren (Du, Gast, Nebengeräusche) oder hast Du b)
2 Spuren wovon eine Nebengeräusche hat?
Ich habe Dein Setup auch noch nicht verstanden.
Wie nimmst Du den Ton auf?
a)
Eine Spur über OBC eine über Skype oder
b)
Beide über Skype, wenn ja mit oder ohne Double-Ender?
Wenn die Nebengeräusche auf einer Spur mit der Sprache sind kann man eigentlich nur filtern.
Audacity [1] bietet hier einige Möglichkeiten. Ich würde aber auf jedenfall auch mal Auphonic [2] ausprobieren.
Du kannst aber keine Wunder erwarten. Aber vielleicht haben andere noch bessere Ideen.