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Speicherst Du die Projekte unter einem anderem Namen ab und lädst dann aber die Projektversion, die nur die ungeschnittenen Aufnahmen hat?

Ansonsten sollte es möglich sein einfach mit Strg-S den Zwischenstand zu speichern und später die Datei wieder auf genau diesem Stand zu laden.

Beschreib mal Schritt für Schritt, wie Du es bisher machst Projekte zu speichern und zu laden. Vielleicht ists nur ein banales Mißverständnis, was wir so schnell erkennen und ausräumen können.