Wie schon geschrieben, ich habe MP3 und M4A getestet.

Und hier zwei m4a-Feed-Beispiele:

http://logbuch-netzpolitik.de/feed/m4a/ --> Kapitelmarken werden in Pocket Casts angezeigt.

http://studierzimmer-podcast.de/feed/m4a/ --> Kapitelmarken werden in Pocket Casts nicht angezeigt.

Edit: Und noch als Ergänzung: Ich nutze wie gesagt .psc (Podlove Simple Chapters)-Dateien, um die Kapitelmarken im Webplayer anzeigen zu lssen. Ich bin mir aber nicht sicher, ob die auch im Feed auftauchen. Es gibt meines Wissens auch eine Variante, bei der man die chapters in der jeweiligen Episode in einem Textfeld angibt. Da der Pocket Casts-Support aber angibt, derzeit keine Podlove chapters zu unterstützen, dürfte das nicht mit dem Problem zusammenhängen.